Jeudi 8 juin 2006 : Le Secrétaire général de l’ONU, Kofi Annan, a désigné Jean-Marie Guéhenno, Secrétaire général adjoint aux opérations de maintien de la paix, pour conduire l'équipe de l'ONU de la mission d'évaluation conjointe Nations Unies/Union Africaine (UA) pour étudier le redéploiement d'une force dans la région du Darfour. La mission d'évaluation étudiera aussi un éventuel remplacement de la Mission de l'Union Africaine au Soudan (MUAS) par une force des Nations Unies qui serait plus puissante ». Le 25 mai 2006, Lakhdar Brahimi, Envoyé spécial du Secrétaire général, avait annoncé que le gouvernement du Soudan autorisait l'envoi d'une telle. Si le Soudan a donné son accord à une mission d'évaluation, il réserve encore son approbation au principe d'un remplacement d'une force de l'UA à une force de l'ONU, avait affirmé le 2 juin 2006, Hedi Annabi, Responsable adjoint des opérations de maintien de la paix.

Vendredi 16 juin 2006 : Le procureur de la Cour pénale internationale (CPI), Luis Moreno-Ocampo, a présenté mercredi 14 juin 2006 au Conseil de sécurité de l'ONU à New York aux Etats-Unis, son 3e rapport sur les crimes commis au Darfour dans lequel il affirme avoir rassemblé des preuves "de milliers d'assassinats présumés de civils" qui incluent des "massacres à grande échelle". Luis Moreno-Ocampo estime à 2 millions le nombre de personnes déplacées et réfugiés. Il note une augmentation du nombre de personnes déplacées entre le milieu de l'année 2003 et le milieu de l'année 2005. Les enquêteurs ont aussi relevé la destruction des biens religieux et des symboles, notamment la destruction de mosquées - environ 65 au Darfour-Ouest - et d'autres lieux de cultes.

Mardi 20 juin 2006 : Le gouvernement et les rebelles de l'Est, qui contrôlent depuis une dizaine d'années l'Hamesh Koreb, une petite zone de la frontière érythréo-soudanaise qui comprend le principal port du Soudan, ont signé un accord de cessation des hostilités et ils sont convenu d'entamer des pourparlers de paix le 13 juin 2006 à Asmara, capitale de l'Erythrée. Les rebelles de l'Est accusent le gouvernement de Khartoum de marginaliser la région tout en exploitant ses ressources naturelles minérales (pétrole, gaz naturel, or) au détriment de la population locale.

Lundi 26 juin 2006 : Le gouvernement a ordonné samedi 24 juin aux autorités locales du Darfour de suspendre les activités de la Mission préparatoire de l'ONU au Soudan (UNMIS, United Mission in Sudan) qu'il accuse d'avoir évacué dans un avion de l'ONU "dans la journée du 24 juin, (...) un leader des mouvements armés d'al-Fashir à Masbad, puis à Kadugli" ajoutant que "l'UNMIS est allé au delà de ses autorités et des missions qui sont stipulées dans un accord conclu entre le gouvernement soudanais et l'ONU".

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